Tinutukoy ng pag-aaral ang bacteria na nauugnay sa preterm labor

Natuklasan ng mga mananaliksik sa North Carolina State University na maraming species ng Gardnerella, bacteria na minsang nauugnay sa bacterial vaginosis (BV) at preterm labor, ay maaaring magkasama sa parehong vaginal microbiome. Ang mga natuklasan, na inilathala sa journal mSystems, ay nagdaragdag sa lumalagong pag-unawa sa epekto ng Gardnerella sa kalusugan ng tao.

Ang Gardnerella ay isang grupo ng anaerobic bacteria na karaniwan sa vaginal microbiome. Ang mataas na antas ng mga bakteryang ito ay isang tanda ng BV at nauugnay sa mas mataas na panganib ng preterm na kapanganakan, ngunit ang mga ito ay matatagpuan din sa mga babaeng walang katibayan ng sakit.

"Sinusubukan naming maunawaan ang pagkakaiba-iba sa loob ng Gardnerella," sabi ni Ben Callahan, isang associate professor ng kalusugan ng populasyon at pathobiology sa North Carolina State University at isang co-author ng papel.

"Kamakailan lamang ay sinimulan ng mga siyentipiko na pag-aralan ang mga indibidwal na species ng Gardnerella, kaya hindi pa namin alam kung ang iba't ibang species ay maaaring magkaroon ng iba't ibang epekto sa kalusugan. Ang aming pangunahing layunin ay pag-aralan ang ekolohiya ng Gardnerella."

Ang isang natatanging hamon ng vaginal microbiome sequencing ay ang anumang sample ay pangunahing binubuo ng host DNA, na ginagawang mas mahal at labor-intensive ang pagkuha ng microbial data. Ang unang gawain ng pangkat ng pananaliksik ay bumuo ng isang pamamaraan na magpapahintulot sa pagkilala sa iba't ibang mga species ng Gardnerella mula sa data ng microbiome.

"Ang mga tool na magagamit upang pag-aralan ang vaginal microbiome ay tinatrato ang lahat ng Gardnerella bilang isang solong species," sabi ni Hannah Berman, isang postdoctoral fellow sa North Carolina State University at nangungunang may-akda ng papel. "Upang gawin ang gawaing ito, kailangan naming bumuo ng aming sariling database ng mga genome ng Gardnerella at bumuo ng isang paraan upang makilala ang iba't ibang mga species ng Gardnerella. Sana, ito ay magpapahintulot din sa mas maraming mananaliksik na pag-aralan ang pagkakaiba-iba ng Gardnerella."

Sinuri ng pangkat ng pananaliksik ang sequencing data mula sa tatlong cohorts: dalawang random na populasyon ng mga buntis na kababaihan at isang populasyon na may kasaysayan ng preterm birth. Sinuri nila ang metagenomic sequence ng Gardnerella mula sa mga sample upang makita kung mayroong kaugnayan sa pagitan ng partikular na species ng Gardnerella at preterm na kapanganakan.

Bagama't hindi nila nakita ang "smoking gun," nakagawa sila ng dalawang nakakagulat na pagtuklas.

Una, natukoy nila ang isang potensyal na ika-14 na species ng Gardnerella sa mga sample-bago ang gawaing ito, 13 species lamang ang natukoy.

Nalaman din nila na sa karamihan ng mga sample na naglalaman ng Gardnerella, maraming Gardnerella species ang magkakasamang umiral sa parehong microbiome: sa pagitan ng dalawa at lahat ng 14 na kilalang Gardnerella species ay natagpuan sa mga indibidwal na sample.

"Karaniwan, kung ang isang species ng bakterya ay kolonisado ang isang kapaligiran, inaasahan namin na ibukod nito ang mga malapit na kamag-anak na sumasakop sa parehong ecological niche at kumonsumo ng parehong mga mapagkukunan," sabi ni Callahan. "Madalas kong sinasabi na sa bacteria, kahit ano ay posible, ngunit ito ay hindi pangkaraniwan. Nakita din namin na kapag ang kabuuang microbial load ay mas mataas, ang Gardnerella ay bumubuo ng isang mas malaking bahagi ng pagkarga na iyon.

"Ang ebidensya ay patuloy na nag-iipon na ang Gardnerella ay nauugnay sa preterm na kapanganakan, ngunit ang mga detalye ng relasyon na ito ay kumplikado. Sa gawaing ito, wala kaming nakitang isang mapanganib na species ng Gardnerella - marahil lahat sila ay nakakapinsala. Ito ay malayo sa dulo ng kuwento."

Inaasahan ng mga mananaliksik na higit pang pag-aralan ang mga isyu ng magkakasamang buhay at komposisyon ng microbiome.

"Ang vaginal microbiome ay hindi pinahahalagahan," sabi ni Callahan. "Halimbawa, madalas itong pinangungunahan ng isang species ng Lactobacillus, na lumilikha ng isang kapaligiran na hindi kasama ang iba pang bakterya. Kapag nawala iyon, nandiyan si Gardnerella. Kaya paano nakikipag-ugnayan ang mga bakteryang ito?

"Ang mga sagot sa mga tanong na ito ay maaaring humantong sa mas epektibong paggamot para sa BV at mga paraan upang mahulaan at maiwasan ang preterm na kapanganakan. Ang gawaing ito ay isang mahalagang hakbang sa prosesong iyon."