Pag-aaral: ang mga gene ay nakakaimpluwensya sa anti-cancer efficacy ng prutas at fiber

Ang isang kamakailang pag-aaral na inilathala sa journal na eBioMedicine ay natukoy ang mga pagkakaiba-iba ng genetic na maaaring magbago sa kaugnayan sa pagitan ng paggamit ng hibla, prutas, at gulay at panganib ng colorectal cancer (CRC). Matagumpay na natukoy ng mga mananaliksik ang dalawang makabuluhang loci na nagbabago sa kaugnayan sa pagitan ng hibla at paggamit ng prutas at panganib sa CRC.

Ang CRC ay isa sa mga pinakakaraniwang kanser sa mundo, na may halos dalawang milyong bagong kaso at mahigit 900,000 na pagkamatay noong 2020. Ang mataas na paggamit ng mga prutas, gulay, buong butil, at dietary fiber ay naiulat upang mabawasan ang panganib ng CRC. Bagama't may matibay na ebidensya ng kaugnayan sa pagitan ng panganib ng CRC at paggamit ng buong butil at dietary fiber, nananatiling limitado ang ebidensya ng kaugnayan sa pagitan ng panganib ng CRC at paggamit ng prutas at gulay.

Natukoy ng mga nakaraang genome-wide association studies (GWAS) ang hindi bababa sa 200 loci na nauugnay sa panganib ng CRC, na nagpapaliwanag ng hanggang 35% ng heritability. Bagama't maaaring ipaliwanag ng mga pakikipag-ugnayan ng gene-environment (G × E) ang karagdagang pagmamana, ang mga nakaraang pag-aaral na may maliliit na sample at tradisyonal na pamamaraan ay nakahanap lamang ng limitadong bilang ng mga makabuluhang pakikipag-ugnayan. Ang mga bagong diskarte sa istatistika, tulad ng mga conjoint na pagsubok at dalawang-hakbang na pamamaraan na nagbibigay-priyoridad sa mga solong nucleotide polymorphism (SNPs), ay may potensyal na mapabuti ang katumpakan ng mga pagsusuring ito.

Hanggang sa 45 na pag-aaral mula sa tatlong CRC genetic consortia kabilang ang mga indibidwal na may lahing European ay kasama sa pagsusuri. Kasama sa mga pag-aaral ang mga set ng case-control para sa mga cohort na pag-aaral at mga kontrol na walang cancer para sa mga case-control na pag-aaral. Isang kabuuan ng 69,599, 69,734, at 44,890 kalahok ang sinuri para sa paggamit ng prutas, gulay, at hibla, ayon sa pagkakabanggit. Tinasa ang paggamit ng pagkain gamit ang mga talatanungan sa dalas ng pagkain at mga kasaysayan ng pandiyeta, na karaniwang ipinapahayag bilang mga serving bawat araw para sa mga prutas at gulay at gramo bawat araw para sa kabuuang hibla.

Ang data ay pinagsama-sama at ipinahayag bilang mga quartile na halaga sa pamamagitan ng kasarian at pag-aaral. Bilang karagdagan, ang kontrol sa kalidad ng genotyping ay kasama ang pagsuri para sa nawawalang data, Hardy-Weinberg equilibrium, at mismatch sa sex, na sinusundan ng imputation at pag-filter para sa menor de edad na dalas at katumpakan ng allele, na nagreresulta sa pagsusuri ng 7,250,911 SNP.

Kung ikukumpara sa mga kontrol, ang mga kalahok na may CRC ay mas matanda, may mas mataas na body mass index at energy intake, at mas mataas na prevalence ng mga risk factor gaya ng family history ng CRC at type 2 diabetes. Kumonsumo din sila ng mas kaunting hibla, prutas, at gulay kumpara sa mga kontrol. Nakakita ang mga meta-analyses ng kabaligtaran na kaugnayan sa pagitan ng fiber (relative risk per quartile increase (OR) = 0.79), prutas (OR = 0.79), at gulay (OR = 0.82) intake at CRC risk.

Ang 3-DF test ay nakilala ang rs4730274 locus upstream ng SLC26A3 gene, na nagpapakita ng kaugnayan sa paggamit ng fiber at isang pakikipag-ugnayan sa panganib ng CRC. Ang stratification sa pamamagitan ng genotype ay nagpakita ng isang mas malakas na kabaligtaran na kaugnayan sa pagitan ng hibla at CRC para sa bawat kopya ng T allele. Iminungkahi ng functional annotation ang aktibidad ng enhancer sa mga colon tissue, na may eQTL para sa DLD gene.

Ang rs1620977 locus malapit sa NEGR1 gene ay nagpakita ng isang makabuluhang kaugnayan sa pagkonsumo ng prutas at isang katamtamang pakikipag-ugnayan sa panganib ng CRC. Ang mga malakas na kabaligtaran na asosasyon ay naobserbahan sa pagtaas ng pagkonsumo ng prutas para sa bawat kopya ng G allele.

Ang pag-aaral ay ang pinakamalaking pag-aaral ng G×E hanggang ngayon, kung saan natukoy ng mga mananaliksik ang dalawang pakikipag-ugnayan sa pagitan ng hibla, paggamit ng prutas, at panganib sa CRC. Sa partikular, ang rs4730274 malapit sa SLC26A3 gene ay nagmumungkahi ng isang makabuluhang kaugnayan sa pagitan ng paggamit ng hibla, pag-andar ng gat, pamamaga, at CRC. Ang mga resulta ay tumatawag para sa karagdagang pag-aaral upang suriin ang mga klinikal na implikasyon at kumpirmahin ang mga natuklasan na ito sa iba't ibang populasyon.