Ang bawat pangunahing lipoprotein ay nailalarawan sa pagkakaroon ng isang indibidwal na protina (apolipoprotein) na likas lamang dito. Ang mga apolipoprotein ay itinalaga ng mga letrang Latin, at ang ilan sa mga ito ay kumakatawan sa isang pamilya ng mga protina at karagdagang itinalaga ng mga numero (halimbawa, apo-A1, apo-A2, atbp.).