Binibigyang-daan ng PCR na maitatag ang presensya ng gonococcal DNA nang direkta at ipahayag ang dami ng kanilang konsentrasyon sa pinag-aralan na materyal. Ang pinag-aralan na materyal ay maaaring plema, lavage fluid, ihi, punctures mula sa iba't ibang organo at cyst, atbp.