Ang sistematikong pagsusuri ng mga variation ng gene ng MUTYH ay nakakatulong upang mas tumpak na masuri ang panganib ng colon cancer

Ang mga gene ay ipinasa mula sa mga magulang at tinutukoy ang mga katangian tulad ng kulay at taas ng mata, pati na rin ang panganib ng ilang sakit.

Bagama't medyo pamilyar ang mga gene na nauugnay sa kanser gaya ng BRCA1 at TP53, karamihan sa mga variant ay nahuhulog sa isang pangkalahatang kategorya na kilala bilang mga variant ng hindi tiyak na klinikal na kahalagahan.

Sa kasalukuyan, ang isang taong may family history ay may limitadong pagkakataon lamang na gamitin ang kanilang genetic screening data upang matukoy ang kanilang panganib para sa karamihan ng mga sakit.

Ang isang kamakailang pag-aaral mula sa lab ni Jacob Kitzman sa University of Michigan Medical School ay nagpapakita ng mga bagong pahiwatig tungkol sa panganib na nauugnay sa mga variant sa isang gene na nauugnay sa kanser sa colon na tinatawag na MUTYH, na ang normal na function ay upang ayusin ang DNA. Ang papel ay inilathala sa The American Journal of Human Genetics.

Ang mga variant sa MUTYH ay maaaring maging sanhi ng abnormal na paglaki na mabuo sa katawan, lalo na sa colon, na nagpapataas ng panganib ng nakamamatay na colon cancer.

Ang mga variant na ito ay karaniwan din: hanggang isa sa bawat 50 tao sa United States ay nagdadala ng mga variant ng panganib ng gene na ito.

"Talagang mahalaga na tukuyin ang subset ng mga tao na may minanang familial risk factor dahil para sa kanila, ang pag-iwas ay maaaring makapagligtas ng buhay," sabi ni Kitzman, isang associate professor ng human genetics.

Hindi lahat ng variant, o mutations, ay pareho.

Ang mga walang katuturang variant ay yaong mga "nasira" ang gene, habang ang magkasingkahulugan na mga variant ay walang epekto at benign.

Ang tinatawag na mga variant ng missense ay nangyayari kapag ang pagbabago sa pagkakasunud-sunod ng DNA ay nagreresulta sa ibang protina na ginawa.

Upang pag-aralan ang mga variant na ito, sa halip na gumawa ng mga modelo ng cell o hayop na may isang variant sa isang pagkakataon at pag-aralan ang anumang mga functional na pagbabago, gumamit ang team ng isang halo-halong modelo, na gumagawa ng lahat ng posibleng variant ng MUTYH, na bumubuo ng isang library ng 10,941 na mga variant.

Pagkatapos ay gumamit sila ng isang reporter ng sistema ng pag-aayos ng DNA upang sistematikong sukatin ang paggana ng bawat variant.

"Sa pangkalahatan, nagpasok kami ng isang oxidative damage sensor sa mga cell na nag-iilaw ng berde kung maayos ang pag-aayos at hindi umiilaw ang berde kung ang pag-andar ng pag-aayos ay may kapansanan," paliwanag ni Kitzman.

Pagkatapos ay hinati nila ang mga cell sa dalawang kategorya: functional at non-functional.

Gamit ang paraang ito, malinaw nilang naihiwalay ang mga variant na walang katuturan mula sa mga magkasingkahulugan (silent) na variant.

Nailalarawan din nila ang isang bilang ng mga variant ng missense na nahulog sa gitnang hanay na may mga epekto na nasa isang continuum ng functionality.

Kinumpirma pa nila ang klinikal na kahalagahan ng mga mutasyon ng MUTYH na ito sa pamamagitan ng paghahambing ng mga ito sa database ng National Center for Biotechnology Information (NCBI) ClinVar, na naglalaman ng mga variant na natuklasan sa pamamagitan ng genetic testing at sinuri ng mga clinician.

"Ito ay lumabas na ang ilan sa mga mutasyon sa MUTYH ay karaniwan sa mga populasyon ng tao, at ang kanilang pathogenicity ay perpektong nakuha ng aming pagsubok," sabi ni Kitzman.

Halimbawa, ang isang variant sa intermediate range ay tumutugma sa isang klinikal na variant na kilala sa pagsisimula at mas banayad na anyo ng polyp development nito.

Bilang karagdagan sa pagbibigay ng higit pang katibayan tungkol sa kung ano talaga ang ibig sabihin ng mga variant ng hindi tiyak na kahulugan, sinabi ni Kitzman na ang ganitong uri ng functional analysis ay maaaring makatulong sa mga tao na gumawa ng mas matalinong mga desisyon tungkol sa pag-iwas sa sakit batay sa kanilang genetic na impormasyon.

"Ang genetic na pagsubok ay nagiging mas at mas karaniwan, at habang nababasa natin ang mga titik sa isang libro, hindi natin alam kung paano gagawin ang mga ito sa mga salita at pangungusap at kung paano maunawaan kung ano ang ibig sabihin ng mga pangungusap na iyon," sabi ni Kitzman.

"Kailangan nating patuloy na pondohan ang pangunahing pananaliksik sa agham upang mapagtanto ang mga tunay na benepisyo, tulad ng kakayahang bigyang-kahulugan ang panganib ng kanser mula sa mga resulta ng genetic testing, na maaaring humantong sa pag-iwas sa pag-save ng buhay."