Sinusuri ng MRI ang estado ng mga istruktura ng utak sa pamamagitan ng kanilang mga balangkas, laki at density ng tissue. Mahalagang tandaan na ang MRI ay sumasalamin sa density ng tisyu depende sa kanilang nilalaman ng tubig, at samakatuwid ay pangunahing kinikilala ang mga naturang sugat tulad ng cerebral edema-swelling (CED), demyelinating disease, at mga tumor.