Ang brainstem ay isang pagpapatuloy ng spinal cord sa direksyon ng rostral. Ang kondisyong hangganan sa pagitan ng mga ito ay ang lugar kung saan lumitaw ang mga unang ugat ng servikal at ang pyramidal decussation. Ang brainstem ay nahahati sa hindbrain at midbrain. Ang una ay kinabibilangan ng medulla oblongata, ang pons, at ang cerebellum. Ang pagpapatuloy nito ay ang midbrain, na binubuo ng mga quadrigeminal na katawan at cerebral peduncles at karatig ng diencephalon (thalamus, hypothalamus, subthalamus).