Ang mga anomalya ng biliary tract at atay ay maaaring isama sa iba pang mga congenital anomalies, kabilang ang sakit sa puso, polydactyly at polycystic disease sa bato. Ang pagpapaunlad ng mga abnormalidad ng biliary tract ay maaaring maiugnay sa mga impeksyon sa viral sa ina, halimbawa, sa rubella.