Ang mga sintomas ng antiphospholipid syndrome ay naiiba sa pagkakaiba-iba. Ang polymorphism ng mga sintomas ay tinutukoy ng lokalisasyon ng thrombi sa mga ugat, arterya o maliit na intragonal vessel. Bilang isang panuntunan, ang mga thromboses ay magbalik sa alinman sa kulang sa hangin o sa arterial bed.