Ang alloimmune, o isoimmune, neutropenia ng mga bagong silang ay nangyayari sa fetus dahil sa hindi pagkakatugma ng antigen sa neutrophils ng fetus at ina. Ang mga isoantibodies ng ina ay nabibilang sa klase ng IgG, pinasok nila ang placental barrier at sirain ang neutrophils ng bata. Ang mga isoantibodies ay kadalasang leukoagglutinins, sila ay tumutugon sa mga selula ng pasyente at ng kanyang ama, huwag tumugon sa mga selula ng ina.